Normal havada %21 oksijen ve %0,04 karbondioksit bulunur. Kontrollü atmosfer (KA; İngilizce CA, controlled atmosphere) deposunda oksijen %1–3’e indirilir, karbondioksit ürüne göre %1–5 arasında tutulur ve sıcaklık 0–3 °C’de sabitlenir. Az oksijen ürünün solunumunu ve etilen üretimini yavaşlatır; meyve sertliğini, asitliğini ve rengini aylarca korur. Normal soğuk depoda 3–5 ay dayanan elma, KA deposunda 8–10 ay saklanabilir. Oksijenin %1,5’in altına indirildiği uygulamaya ULO (ultra low oxygen, çok düşük oksijen) denir.
Donanım, sıradan bir soğuk odanın üstüne eklenir: ek yerleri özel macun ve bantla kapatılmış gaz sızdırmaz paneller, contası sıkıştırılan gaz sızdırmaz kapı, oksijeni düşüren azot jeneratörü, fazla karbondioksiti tutan aktif karbonlu ya da kireçli yıkayıcı (scrubber), sürekli ölçüm yapan gaz analizörü ve otomasyon. Oda basıncı sıcaklıkla oynadığı için basınç dengeleme valfi ve esnek denge torbası şarttır. Sızdırmazlık devreye almadan önce test edilir; yaygın bir kabul ölçütü, odaya verilen 250 Pa basıncın yarıya düşmesinin 20–30 dakikadan uzun sürmesidir.
Soğutma tarafında da farklar vardır. Oda aylarca açılmadığından kapı yükü yoktur, ama ürün canlıdır ve nem kaybı doğrudan fire olur; bu yüzden evaporatör geniş yüzeyli, 3–5 K gibi düşük sıcaklık farkıyla seçilir ve bağıl nem %90–95’te tutulur. Odalar hızlı doldurulup kapatılmalıdır: iyi uygulamada dolum bir haftayı geçmez, ürün önce soğutulur, sonra oksijen düşürülür. Her çeşidin oksijen ve karbondioksit sınırı farklıdır; sınırın altında oksijen ürünü fermantasyona, fazla karbondioksit iç kararmasına götürür.
En önemli uyarı iş güvenliğidir: KA odasındaki hava insanı birkaç nefeste bayıltır ve öldürür, üstelik hiçbir kokusu ya da uyarısı yoktur. Oda havalandırılıp oksijen ölçümü %20’nin üstüne çıkmadan içeri girilmez; kapılar kilitli ve uyarı levhalı tutulur. Oda açıldıktan sonra ürün birkaç hafta içinde satılmalıdır, bu yüzden büyük tek oda yerine 100–300 tonluk birden çok oda tercih edilir. Ürünlerin sıcaklık ve nem istekleri gıda saklama koşulları rehberinde yer alır; soğutma yükü hesaplayıcısı her oda için ön kapasiteyi verir.